NVIDIA 與 Evozyne 合作以 NVIDIA BioNeMo 框架建構蛋白質生成的 AI 模型,將加速藥物設計速度與減緩暖化現象

2023.01.12 10:00PM
照片中包含了電腦牆紙、文本、圖形、牆紙、生物

NVIDIA 宣布新創公司 Evozyne 透過 NVIDIA 的 NVIDIA BioNeMo 框架,利用 AI 大型語言模型技術作為蛋白質生成創建 AI ,使 AI 模型能產生與天然蛋白質相同的優質合成蛋白質,將可做為治療先天性疾病與消耗二氧化碳使暖化現象趨緩。

▲ Evozyne 利用 NVIDIA BioMeMo 的 Transformer 模型 NVIDIA ProT5 執行專案

Evozyne 利用隸屬 NVIDIA BioMeMo 的 Transformer 模型 NVIDIA ProT5 執行專案項目,是專用於醫療保健領域建構 AI 模型的軟體框架與服務,並作為 Evozyne 旗下的 ProT-AVE 工作流程核心,把 BioNeMo 與充當篩檢器的變分自動編碼器結合,能夠以低成本於模型進行各項作業,使 Evozyne 的工程師可在數秒產生數百萬個序列組合。

▲ BioNeMe 將胺基酸序列視為文字並活用大型語言模型技術進行訓練,顛覆蛋白質生成技術

此項技術將大型語言模型技術轉化至生物醫學領域,透過 NVIDIA Transformer 模型讀取蛋白質中數百萬種氨基酸序列,利用神經網路將這些胺基酸序列視為文字並加以理解,接著及可預測與配合 Evozyne 產生用於解決問題的蛋白質。傳統蛋白質生成的定向進化方式一次僅能改變幾個胺基酸序列,是一種碰運氣的緩慢方法,但 Evozyne 藉由結合 NVIDIA BioNeMo 技術,可在同一輪改變蛋白質半數的胺基酸,等同一次進行數百次突變。

同時借助 NVIDIA 的加速技術, Evozyne 能夠活用多個 GPU 進行訓練與加速處理龐大的作業流,使得 Evozyne 能在每分鐘處理一個完整的資料庫數據,並將大型 AI 模型的訓練時間減至一週內,並能訓練涵蓋數十億個訓練參數的模型。